垂直流超凈工作臺和水平流超凈工作臺有不同的效果。超凈工作臺根據(jù)氣流的方向分為垂直流超凈工作臺和水平流超凈工作臺，垂直流工作臺風(fēng)機在頂部，噪音較大，風(fēng)垂直吹多用在醫(yī)藥工程，垂直流風(fēng)保證人的身體健康；水平流工作臺噪音較小，風(fēng)向往外，多用在電子行業(yè)。
1、水平層流超凈工作臺：是一種通用性較強的局部潔凈工作臺，它廣泛用于電子、國防、精密儀器、儀表、制藥行業(yè)等。
2、垂直層流超凈工作臺：垂直單向流超凈工作臺廣泛應(yīng)用于需要局部潔凈的區(qū)域。實驗室、生物制藥、光電產(chǎn)業(yè)、微電子、硬盤制造等領(lǐng)域。
水平送風(fēng)與垂直送風(fēng)工作臺都能滿足實驗需要，所要考慮的就是氣流流型（根據(jù)實驗看哪種送風(fēng)形式對實驗影響最小）。
一般都是用垂直的；垂直送風(fēng)的也就是垂直向下吹，垂直流形，準閉合式臺面，可有效防止外部合流透入及操作異味對人體的刺激。如果在工作臺里放顯微鏡,那垂直送風(fēng)的氣流會被顯微鏡阻擋，這種情況就要選擇水平風(fēng)；但一般的實驗都用垂直的，玻璃門一般都是上下移動的。
總的來說，水平與垂直送風(fēng)不存在明顯的優(yōu)劣之分，根據(jù)實驗要求選擇合適的類型。
超凈臺使用壽命的長短與空氣的潔凈度有 。在溫帶地區(qū)超凈臺可在一般實驗室使用，然而在熱帶或亞熱帶地區(qū)，由 大氣中含有 量的花粉，或多粉塵的地區(qū)，超凈臺則宜放在較好的有雙道門的室內(nèi)使用。
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